El área La religión muestra las principales divinidades indígenas, los mitos y los espacios sagrados de las distintas sociedades americanas. En estas salas de pueden conocer los ritos funerarios, los de fertilidad, etc., y los objetos sagrados asociados a los mismos. Además, en este área se tratan los rituales y conceptos religiosos que fueron introducidos a América tras la llegada de los europeos.
Todas estas sociedades establecieron sus propias fórmulas de relación con lo sobrenatural. Por esta razón, el área dedicada a la religión ofrece la posibilidad de conocer diferentes formas de establecer un diálogo con lo sagrado a través de los objetos que fueron usados como ofrendas o que formaron parte de diversos rituales.